Tout commence par une beauté géologique aux dimensions surprenantes. L’imposant porche d’entrée mesure près de 35 mètres de haut et 28 mètres de large. Il a été creusé dans le calcaire : roche sédimentaire datant environ de 170 millions d’années. Elle s’est formée au fond d’une mer qui a quasiment recouvert l’ensemble de la France de – 230 Millions d’années à – 65 millions d’années. Après une longue période d’accumulation, les sédiments laissés par la mer ont formé une boue, se sont transformés, et ont donné la roche calcaire.

A l’ère tertiaire, il y a environ 30 Millions d’années, le plateau de l’Isle Crémieu a émergé et la roche a été attaquée par les eaux de pluie ou de fonte des glaciers qui ont creusé les galeries et les cavités.

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Ce porche majestueux abrite deux chapelles superposées du IXème et XIVème siècle, ajoutant une beauté singulière dès l’entrée du site. La chapelle haute a été bâtie en 1310 et est dédiée à la Vierge. Elle a été érigée sur une chapelle plus ancienne construite au IXème siècle, dédiée elle à Saint Jean-Baptiste. Des travaux de restauration ont été effectués en 1885 : reconstruction de l’escalier d’accès, de la façade ouest en partie, de l’arcade d’entrée et de la voûte de la chapelle haute.

Ensemble, elles ont été un lieu de pèlerinage : ainsi, en 1516, François 1^er et sa mère Louise de Savoie sont venus s’y recueillir.